区别仅在于文凭、入学方式、学制年限、名额限制、学习形式、毕业证书不同。

1、文凭不同 自考本科属于非全日制成人教育，是第二学历，而普通本科属于全日制统招本科文凭，是第一学历，普通本科是社会生最受认可的学历形式，但是二者都是国家承认的正规文凭，学信网上都可以查到的。

自考本科是通过自己的学习，通过成人高考参加的而获得的本科的。文凭高考本科是通过全国参加高考去上的，本科的一所学校，两者都是本科的学历，他们是都一样的学历，没有什么太大的区别。