琴弦数量不同：中阮有四根弦；吉他通常是六根弦。

起源不同：中阮起源大约在公元前217至公元前105年，在汉时称为秦汉子或秦琵琶，是中国自己创造的一种直项、圆体、12柱（品）、四弦的乐器；吉他的起源可以追溯到公元前两三千年前古巴比伦、古埃及的耐法尔、古波斯的各种古弹拨乐器，最古老的是公元前1400年。

中阮是民乐，吉他是西乐；中阮是四根弦，吉他是六根弦；中阮用拨片弹，吉他用手或拨片均可。