昆明卫校的前身是成立于1941年的云南省立医学专科学校，1986年更名为昆明医学院，2015年更名为昆明医科大学。

目前，昆明卫校共有3所学校，分别是昆明医科大学、云南中医药大学和昆明市卫生学校。