不能随便加一层。

因为，农村建房，首先要农户通过村委会向有关部门申请，规划，经过土地，城建，环保等部门批准后才能去施工，待房屋建成后，经过验收，方可入住。如果在不经过批准，私自加一层，是属于违建，另外设计是三层，另外再加一层，会严重影响房屋建筑质量，构成不安全隐患，最终导致不能居住。

不可以，申请几层就建几层。