福建工贸学校的两个校区是指福州校区和厦门校区。

这两个校区在地理位置上有明显的差异，福州校区位于福州市中心，而厦门校区位于厦门市中心。此外，两个校区的教学设施和资源也有所不同，福州校区拥有更多的实验室和工作室，而厦门校区则更加注重与当地企业的合作，提供更多的实习和就业机会。另外，两个校区的专业设置也有所差异，福州校区更偏重于工程类专业，而厦门校区更注重商贸类专业。总体而言，福建工贸学校的两个校区在地理位置、教学资源和专业设置上存在明显的差异。