要分别赔偿费用的性质，如果是违反购销合同等支付的赔偿费用，一般分别记入“管理费用”或“销售费用”等会计科目，与生产经营无关的赔偿费用，一般应记入“营业外支出”科目。

按财务制度规定，赔偿费用进“营业外科目”，但根据税法规定，在申报企业所得税时，应在申报表中将赔偿费用调增应纳税所得额，不允许税前扣除。赔偿不需要发票。因为不是买卖关系，开收据就可以了。因为是导致部分货物破损，所以完整的分录：借：材料采购或在途物资应交税费——应交增值税（进项税额）贷：银行存款等入库时：借：库存商品等其他应收款——物流公司贷：材料采购或在途物资将来收到款项时：借：银行存款贷：其他应收款同时注意部分货物破损的情况。

物流公司货物丢失赔偿的会计分录： 明确丢失后， 借：待处理财产损益 贷：库存商品/在途商品 明确赔偿金额后， 借：其他应收款 贷：待处理财产损益 如果有保险赔偿或其他赔偿收入，也一并转入待处理财产损益。 清理完毕后，根据待处理财产损益的余额转入营业外收支。

其他应收款科目属于资产类科目，用来核算企业应收的除应收账款、应收票据、应收股利和应收利息以外的应收的其他款项，如应收的赔偿款和罚款，应收的为职工及其家属代垫的款项，应收的支付的保证金等等。企业货物的赔偿款应记入其他应收款科目，会计分录是借：其他应收款，贷：营业外收入。