截至2017年10月，学校拥有1个福建省特色重点学科、5个福建省一级重点学科、9个福建省二级重点学科、3个学术学位一级学科硕士点、2个专业学位授权类别、2个专业学位授权领域。

福建省一流学科建设：

福建省特色重点学科

材料科学与工程

交通运输工程、材料科学与工程、土木工程、机械工程、管理科学与工程

福建省二级重点学科：

交通信息工程及控制、材料加工工程、岩土工程、结构工程、

福建职业技术学院招生专业有会计电算化、建筑工程管理、汽车运用技术、应用电子技术、金融保险、房地产经营与估价、计算机网络技术、广告设计与制作、市场营销、旅游管理、城市轨道交通车辆等