中科大微尺度国家实验室即合肥微尺度物质科学国家实验室，代表着该学科在国家的顶尖水平。

国家实验室代表国内实验室的最高水平，是按国际一流标准建立的大规模实验室，基本包括本学科领域所有研究方向，而且人员配备上要求面向国内外招聘最优秀的研究人员，直接参与国际竞争，往往是多学科交叉的创新平台。中国科大是国内唯一拥有两个国家实验室的大学。分别为同步辐射国家实验室和合肥微尺度物质科学国家实验室，一个国家实验室的投资一般为10亿，而一个国家重点实验室的投资一般只有2亿左右，可以说国家实验室是举全国之力建立的国家顶级实验室，旨在打造世界知名实验室！重点实验室多数都与工科关系密切，理科类实验室相对较少，科大其实很多研究室偏重理科方面的，所以国家重点实验室不是很多，但两个国家实验室足以说明科大的科研实力！

劳伦斯伯克利国家实验室现有3800名雇员，其中相当一部分是伯克利分校的老师和学生，2004年的财政预算超过5亿美元