本科线指的是二本分数线。

首先在新高考政策下，现在基本上本科的录取批次中将二本与三本合并在一起，所以本科线一般是指最低的二本分数线，本身各省市教育部门将不同层次学校、不同分数段考生安排在本科一批、本科二批、本科三批等批次填报志愿和录取，也就是我们说的一本、二本、三本，所以就有对应的最低分数线。