科技职业技术学校主要开设了机械工程、电子信息工程、计算机科学与技术、经济管理、外国语、艺术与传媒等六个专业。

其中，机械工程专业是学校的特色专业，主要培养学生掌握机械工程领域的基础理论和实践技能，能够从事机械设计、制造、质量控制和生产管理等工作。

万州科技职业学院的专业主要有财会专业，环境工程专业，计算机管理专业，烹饪专业，汽车维修管理专业，软件工程专业等。