上海交通大学农业与生物学院的前身，是创建于1959年的上海农学院。

1999年9月，上海农学院并入上海交通大学，成立上海交通大学农学院。

2002年3月，更名为上海交通大学农业与生物学院。学院设有植物科学与技术、动物科学、食品科学与工程、农业资源与环境4个全日制本科专业。一级学科博士学位授权点3个(园艺学、生态学、食品科学与工程)。一级学科硕士学位授权点4个(园艺学、畜牧学、生态学、食品科学与工程)。专业硕士学位授权点3个(农业硕士、兽医、生物与医药)。