南京工业大学国家专项有生物工程专业、安全工程专业、化学工程与工艺专业、计算机科学与技术专业、土木工程专业、过程装备与控制工程专业、冶金工程专业、材料科学与工程专业、无机非金属材料工程专业、高分子材料与工程专业、金属材料工程专业、复合材料与工程专业等12个专业。