自考的两个专业有相同科目的，可以免考。

但并不是系统自动免考，而是你需要按照自考办的要求来办理免考手续。具体程序可以查阅本省发布高等教育自学考试信息的网站。如果同时报了两个专业，一科未过不会影响另一专业拿毕业证的，各是各的。