考研初试报考的是药学专业，复试时是否可以选择中药专业，这主要取决于所报考的学校及其相关规定。

一般来说，如果该校的药学专业和中药专业都属于同一学院或系所，且复试允许跨专业选择，那么就有可能在复试时选择中药专业。但是，如果两个专业分属不同的学院或系所，或者学校有明确规定不允许跨专业选择，那么就不能在复试时选择中药专业。因此，建议在报考前仔细阅读招生简章或咨询学校相关部门，了解具体规定和要求。