48.1公里。

根据查询地图可知：杭州南站到浙江中医药大学富春校区相距杭州南站（Hangzhounan Railway Station），位于中国浙江省杭州市萧山区境内，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的一座铁路车站，是杭州钱塘江南岸的一座客运火车站，也是杭州铁路枢纽的主要客运站之一。浙江中医药大学富春校区地址是浙江省杭州市富阳区百川街。

浙江中医药大学有2个校区，分别是位于浙江省杭州市滨江区滨文路548号的滨文校区和位于浙江省杭州市富阳区高科路的富春校区。

滨文校区在滨江，学校附近有地铁站，交通方便。富春校区在富阳，离主城区较远，坐公交车需1小时以上。