要教师资格认定申请表要放在档案里，如果其有教师资格证书，档案中应该有一份与档案和证书要求一致的确认表，教师资格申请表应当记入个人档案，由教师资格认定机构负责。

如果教师资格认定的申请表没有归入个人档案，或者目前还在申请认定的人自己手里，说明个人的人事档案不归教育局管理，在这种情况下，申请认定的人要到认定教师资格的教育局要回自己的认定申请表，把其交给个人档案管理的机构。