助理工程师证书在网上是没有办法查询的，因为助理工程师的证并没有在网上上传，在网上能查到的证是中级以上职称，助理工程师是初级证书，用人单位可以去电话到发证机关职称科查询;您的用人单位可以去函到发证机关职称科核实证书的真实性。