《黄帝内经》对儿科疾病已有记述，在《史记》中扁鹊在秦国医小儿病是中国最早的小儿医。

1973年长沙马王堆3号汉墓出土的帛书医方中也发现当时已有婴儿索痉、婴儿病痫等记载。唐代孙思邈著《备急千金要方》已按病症分类记述小儿疾病。唐朝开始在太医署内设少小科与内、外、五官科并列。

19世纪后期，随着医学科学的发展，医疗服务日益向专科化方面发展。为了同这一趋势保持同步，医学院校中的课程设置也开始分化。在美国，儿科学作为一个独立的专业开始于19世纪末和20世纪初。