自考本科的档案主要包括学籍档案和证件档案两部分，以下是具体操作步骤：

1. 学籍档案学籍档案归所在高校保管，包括自考报名表、录取通知书、入学考试成绩单、学习计划、成绩单、学历证书申请表等文件。

学籍档案需要办理的手续有：（1）毕业前，到学校教务处申请领取在读证明；（2）毕业后，到学校教务处申请领取成绩单和学位证书，并及时领取学历证书。

2. 证件档案证件档案是指自考本科毕业生的各类证件、材料等，包括身份证、毕业证书、学位证书、成绩单等。证件档案需要办理的手续有：（1）领取毕业证书和学位证书后，及时登记到相关部门，例如教育部学历证书电子注册备案平台等；（2）办理毕业证书和学位证书公正，公证处可以提供这项服务；（3）如果需要申请学位认证或海外学历认证，需要提供相关证件原件或公证件等材料。需要注意的是，为了保证自考本科的档案完整性和真实性，建议毕业生将学籍档案和证件档案定期整理和归档，妥善保管相关证件和材料，以备日后使用。

如果专科和本科都是自考，就需要找到原来的高中或者中专档案，将档案放在一起，一起存放在人才中心，不转移的话就默认在人才中心存放