昆明东方启明星有两个校区。

因为官方网站上明确标注了昆明东方启明星主校区和昆明东方启明星南校区，这两个校区都有教学楼、学生宿舍、图书馆等基础设施，为学生提供了充足的学习和生活场所。同时，还有明确的接收地址和联系方式，方便学生和家长进行咨询和报名。