熊猫基地与研究中心的区别是：行政系统不同。

熊猫基地，主管部门为住建部，由成都住建局分管。前身为成都动物园，1987年成立，与成都动物园“一套班子，两块牌子”，1990年后，逐渐分为两个实体。研究中心，主管部门为林草局（副部级），由林草局直管。