内蒙古自治区的高考志愿填报系统支持使用手机进行填报，但需要注意的是，手机和电脑网页系统不同，在填报时可能会出现乱码、页面过小等问题，容易忽略一些重要信息。

因此，虽然技术上允许使用手机进行填报，但出于对填报准确性和效率的考虑，不太建议使用手机进行高考志愿填报。