科层组织是依照以下原则来建立和组织运行的规则：

1. 分工原则：科层组织将工作划分为不同的职位和部门，每个职位都有明确的职责和权限。

2. 等级原则：科层组织中存在明确的等级制度，上级对下级有指导和监督的权力。

3. 规则原则：科层组织强调规章制度的制定和执行，所有成员都必须遵守规则。

4. 非人格化原则：科层组织中的成员必须以公正、公平的态度对待工作和同事，不能因为个人情感影响决策。

5. 专业化原则：科层组织中的员工需要具备专业的知识和技能，以保证工作的高效和质量。

6. 效率原则：科层组织追求的是工作效率和效果，通过标准化和规范化的工作方式提高生产力。