南京和澳门之间隔海相望，需要经过海关才能通行。

南京飞往澳门，需要先飞往香港国际机场（HKG），然后通过港珠澳大桥或直升机前往澳门国际机场（MFM）。在香港国际机场转机时，需要通过香港海关检查入境手续，出境时再通过澳门海关检查入境手续。