莆田学院和三明学院都是一流的学府，但选择哪个更好取决于个人的喜好和需求。

莆田学院拥有更丰富的专业设置和更多的科研资源，而三明学院在教学质量和学生关怀方面更加突出。因此，如果你对专业选择和科研有更高的要求，可以选择莆田学院；如果你更注重教学质量和学生关怀，那么三明学院可能更适合你。最终的选择应该基于个人的兴趣和未来规划。