云南中医药大学以本科教育为主，高职高专为辅，有的专业甚至是一本招生。

以前有过专科专业，比如中药栽培技术，后来取消了，现在好像没有专科专业，只有成人教育。

2024年云南中医药大学专升本招生专业及对应招收专科专业信息已经发布,共计2个招生专业,中医学招收专科专业有士医学、申医骨伤;针灸推拿学招收专科专业有针灸推拿。