南宁地区畜牧兽医站是崇左市畜牧兽医站的前身，南宁地区撤销、成立崇左市，办公地点由南宁市西乡塘区友爱北路迁移到崇左市，因此就变成崇左市畜牧兽医站。

该站是一个事业单位，承担崇左市人民政府的畜牧养殖、疫病防治、动物及其产品质量监督检查，保障人民肉食品安全等任务。