应该说不相上下。

从大学的名气来说，扬州大学肯定好于南通大学，扬州大学自1992年国家教育部批准组建以来，不断发展壮大，其规模和实力都远胜于南通大学。从医学院来说组建前的南通医学院好于扬州医学院，虽然护理学差不多，但南通医学院整体实力优于扬州医学院。随着扬州大学的名次不断提升，扬州大学医学院及其护理学也水涨船高。