南京市中考指标生填报需要注意以下几点：

1. 指标生录取根据各初中校的指标数和考生所填志愿，从高分到低分择优录取。

2. 原市区普通高中指标生录取控制线按全市中考成绩排名前30%考生的最低分划定，其他区可参照执行。

3. 想要获得指标生的填报资格，需要满足以下几点：在本市就读的应届毕业生；在学籍所在初中学校实际就读满三年的考生(没有转学),且初二小中考的生物地理都合格，初三艺术综评合格；综合素质评价：道德品质、公民素养、交流与合作均为合格等等，学习能力、运动与健康、审美与表现均为B级以上；中考分数达到指标生投档线，即全市中考成绩排名全市的前30%的考生。

4. 录取规则：同校竞争，择优录取。