入学方式不同：远程教育是学校自主组织入学测试（每年3月和9月两次报名入学），函授教育通常是通过成人高考入学（每年8月底9月初报考，10月份进行成人高考）；办学主体不同：远程教育办学资格学校全国只有对外经济贸易大学、电子科技大学等68所高校，而几乎所有大学、学院、职技院等的成教院或继续教育学院都可以招收函授生；毕业证号不同：远程教育毕业证电子注册号第6位通常是7，函授教育毕业证的是5；证书内容不同：通常在证书上会注明：远程教育，函授。

教学组织不同：函授教育每学期按照教学计划，在业余时间进行集中面授，远程教育不集中面授。