助理工程师证书在网上是没有办法查询的，因为助理工程师的证并没有在网上上传，在网上能查到的证是中级以上职称，助理工程师是初级证书，用人单位可以去电话到发证机关职称科查询;您的用人单位可以去函到发证机关职称科核实证书的真实性。

大部分省份特别是比较偏远的省份都是向发证所在地人力资源和社会保障局的专业技术管理办电话或发函查询，部分省份是在发证当地人事局官网上面查询，不论哪种方式都是承认的，都可以使用的。