吉林农业科技学院由原吉林省农业学校和原吉林特产高等专科学校合并组建，2003年原吉林省农业学校并入原吉林特产高等专科学校，2004年5月，经教育部批准，升格为吉林农业科技学院。学校前身为1907年清朝末期，在吉林的东局子成立了“农学堂”，为此吉林农业科技学院建校114年。