专本贯通的认可度是不如三本的认可度，因为三本是民营的本科学校，招收的是高考二本分数线以上的学生。而专本贯通，首先是在专科批次录取学生，学生读三年专过后再通过，专升本到本科院校再读二年。从成绩来看，专科生的成绩和本科生的成绩还是有很大差异的。

另外在专本贯通的本科毕业证上，会有专科起点本科的字样，而三本的毕业证上是全日制四年制本科。所以三本的含金量要高于专本贯通的含金量。