乡医补助应该是由卫生行政部门或者政府社区部门管辖的，因为乡医是属于村里面的乡村医生，所以很大可能直接是由当地的社区部门管辖补助，社区部门负责把补助的钱每月发放给乡村医生，或者是有卫生行政部门直接发放给乡村医生，具体还得去当地了解才行