内蒙古民族大学有两个校区，分别是位于通辽市科尔沁区的北校区和位于通辽市奈曼旗的南校区。北校区占地面积约为3000亩，是学校的主校区，包括教学楼、实验楼、行政楼、学生公寓等多个建筑群。

南校区则是该校的分校区，占地面积约为500亩，主要是用于农业科技研究和实践教学。

内蒙古民族大学共有两个校区，霍林河校区和西拉木伦校区。校本部在霍林河校区。