军校毕业不可以自己选择军种。在考取军校之后，你就已经确定上哪所军校了，上军校的时候也同时确定了你所在的军种，这样的话，你在军校的四年时间里，开始专门系统的进行专业课的理论知识学习，等到毕业考试后，开始分配到你所属的部队，不能改变军种。