首先，两者的定义不同。安全员上岗证是一种证明安全员专业知识和技能的证书，是从事安全生产管理工作的必要条件，也是个人能力和价值的体现。而专职安全员C证，全称是安全生产考核证书，是由国家安全监管部门颁发的专门安全员职业技能等级认证证书。

其次，两者的使用范围也有所不同。安全员上岗证的应用范围相对较广，不特定于建筑行业，如在危险品生产、道路运输等领域也可以使用。而专职安全员C证则主要针对建筑企业的专职安全员，负责项目施工的安全保障。

此外，两者的申请条件和获取方式也可能存在差异。通常，安全员上岗证的申请需要符合一定的条件，并通过相应的考试和实践操作来证明申请人的安全工作能力和素质。而专职安全员C证的申请条件和获取流程可能具有其特定的要求和程序。

总的来说，安全员上岗证和专职安全员C证在定义、使用范围以及申请条件和获取方式等方面存在区别。具体选择哪种证书，应根据个人的职业发展方向和所在行业的特定需求来决定。