不可以。

根据政策规定，同一自然年内，一个申请人只允许申请一种教师资格。如果考生在当次申请认定期间已经注册申请过一种教师资格，则不能再注册申请另一种教师资格，需要等到第二年再申请认定另一种教师资格。这意味着，即使是在同一学段同一学科的情况下，也不能在同一年内认定两本教师资格证。此外，教师资格笔试和面试成绩只能作为一次认定使用，一种证书认定之后，要认定另一种，笔试和面试需要重新考试。因此，根据现有的政策规定，同一学段同一学科的教师资格证也不能同时认定两本。