两者都是全国通用的，区别主要在于：

1、发证机关和管理机关不同。省证是广东省财政厅发的，所以拿证以后会计档案的管理部门也是省财厅；市证是广州市财证局发的，拿证后会计档案由广州市各区财局管理，如在天河区报考的以后就由天河区财局管理。

2、需要调转档案情况不同。省证只要在全省范围内工作都不用调转档案，只有跨省工作的时候才需要调转档案；市证如果跨区工作就需要调转档案。

3、继续教育管理机构不同。