1、适用的范围不同。

核准制适用于企业不使用政府资金投资建设的重大项目和限制类项目；备案制适用于企业投资中的中小项目。

2、审核的内容不同。

核准制只是政府从社会和经济公共管理的角度审核，不负责考虑企业投资项目的市场前景、资金来源、经济效益的因素。

核准，审核后批准。备案，向主管机关报告事由存案以备查考。