没关系的，只要是药学，学的专业知识是一致的，杭师大药学专业的基础是原杭州医高专药学专科，在杭州地区口碑相当不错，后来与杭州师范合并后改为药学本科专业，属于健康管理学院，现有国内首个中医治未病的博士点，很有前景。已有2006-2008届毕业生的真实就业率也肯定超过95%的。