深圳迈瑞医疗电子股份有限公司的采购部门是否加班，要看具体的工作安排和需求。一般来说，采购部门的工作需要处理大量的采购订单、协调供应商、跟进物流等事务，因此可能需要在工作时间内进行加班处理。但是，加班是否严重取决于具体的工作安排、工作量、个人工作效率等因素。

迈瑞医疗是一家大型医疗器械公司，其采购部门的工作涉及到大量的采购订单和供应商协调，因此加班的情况可能比较常见。另外，该公司采用现代化的管理模式和信息技术，也可以提高工作效率，减少加班的需求。

总之，具体情况需要结合深圳迈瑞医疗电子股份有限公司的实际情况来判断。