公元1904年（清光绪三十年），云南蚕桑学堂正式成立，首任校长林志恂，校址位于昆明翠湖原云南讲武堂旁。学校多次搬迁几经沧桑，先后更名为“省会中等农业学校”、“省立甲种农业学校”、“省立第一农业学校”、“昆华高级农业职业学校”、“昆明农业技术学校”等等。

2002年12月，暌隔多年的两所姊妹学校——云南省农业学校和云南省畜牧兽医学校，秉执百年学魂，应历史之潮流重新聚首合并，成立了“云南农业职业技术学院”。