主要区别是有无处方权。

第一，口腔助理医师无开处方的资格；

第二，口腔执业医师有开处方的资格。

第三，口腔职业医师专业毕业满五年是可以申请开诊所的；而口腔助理医师只能配合从事口腔助理工作。