会被扣学分，《学生军事训练工作规定》第四十五条 对没有正当理由拒不接受军事训练的学生，按国家发布的学籍管理办法和学校有关规定处理。

《兵役法》第四十五条 普通高等学校的学生在就学期间，必须接受基本军事训练。

大学生军训是由教育部、国防部负责，学校组织，军事部门承办的国防教育活动。任何大学，军训都是一门必修课，计入学分系统。