两个专业各有所长，无法绝对的比较哪个专业含金量更高。

具体来说，学习的时候对哪一科感兴趣就是含金量较高的。执业的时候要看自己生活所处区域是水域多一些，还是动物兽类饲养环境多一些。多一些的用武之地相对就充分一些。

全国执业兽医资格考试分为兽医全科类和水生动物类两类。兽医全科一般是动物医学、畜牧兽医专业的。水生物类的兽医一般是水产养殖等专业的。