农村水利工程维修资金的使用办法如下：

1. 维修资金的来源：维修资金的主要来源包括政府拨款、农村水费收入、农村水利基金等。

2. 维修资金的管理机构：设立专门的水利维修资金管理机构或委托相关部门负责管理。

3. 维修资金的使用范围：维修资金主要用于农村水利工程的日常维修、设备更新、抢险应急等费用。

4. 维修资金的使用方式：采取拨款制度，由资金管理机构根据实际情况制定具体的资金使用计划，并按照一定的程序进行资金拨付。

5. 维修资金的使用管理：建立健全的资金使用管理制度，对资金的使用进行监督和审计，确保资金使用的合理性、规范性和效益性。

6. 维修资金的监督与考核：建立监督和考核制度，加强对资金使用情况的监督和检查，对使用不当、浪费等行为进行处罚或追责。

7. 维修资金的公开透明：通过公告、报告等方式，向社会公开发布维修资金的来源、使用情况，接受社会监督。

8. 维修资金的节约使用：提倡节约型使用维修资金，采取科学的维修方案、合理的材料采购等方式，减少资源的浪费和资金的损失。以上为一般的农村水利工程维修资金使用办法，具体可根据实际情况进行调整和完善。

农村水利工程维修资金是农村用于水浇设施和防汛设施的维修资金，必须专款专用，超过一定数额的大项开支，必须经过村民委员会和村民代表讨论通过，要有招标，小的开支，要保证使用效果。