华中农业大学其办学源头溯源于1898年清朝光绪年间湖广总督张之洞创办的湖北农务学堂，是中国高等农业教育的重要起点之一；学校前身华中农学院由武汉大学农学院、湖北农学院全部系科以及原中山大学、原南昌大学等6所综合性大学农学院的部分系科在1952年组建而成，1985年更名为华中农业大学。

学校始创于1909年的广东全省农事试验场暨附设农业讲习所。

1952年，由中山大学农学院、岭南大学农学院和广西大学农学院畜牧兽医系及病虫害系的一部分合并成立华南农学院，隶属农业部主管。

1984年，更名为华南农业大学。

2000年，学校由农业部划归广东省主管。