伊犁客运资格证的办理流程大致如下：

1. 报名参加职业培训：申请人应首先到具有营运驾驶员职业培训资格的机构报名参加职业培训。

2. 准备相关材料：申请人需持有机动车驾驶证、非职业驾驶员培训结业证书。申请营业性大型客车、汽车列车从业资格证的，还需符合以下条件： - 申请大型客车从业资格证，须持 A 照 2 年以上； - 申请汽车列车从业资格证书，须持有 B 照 2 年以上。

3. 提交申请材料：申请人员应当履行下列手续： - 填写《营运驾驶员从业资格证申请登记表》； - 交验机动车驾驶证、身份证复印件； - 提供道路交通安全主管部门出具的三年内无重大以上交通责任事故记录证明材料。

4. 参加考试：提交的材料没有问题并且符合申报条件后，申请人将被安排参加考试。考试内容主要包括道路运输法规、机动车维修和货物装载保管基本知识。

5. 领取资格证：考试合格后，申请人可以领取营运驾驶员从业资格证。需要注意的是，各地的具体办理流程可能略有差异，请根据当地交通局运管所的要求准备材料和办理。同时，办理过程中如有疑问，可以向相关部门咨询。

客运资格证必须要有大客执照才行，有了大客执照，可以到客运站办理，首先你要申请客运资格证了，批准了你就可以营运了。