如果上海居转户初审通过后，复核环节发现资料有误或者缺失，那么会被退回进行补充修改。

因为居转户是涉及到户口迁移的事项，需要各种资料的准确齐全，保证数据的真实性和完整性。如果复核发现有问题，会通知申请人进行补交或修改，直至满足要求为止。所以，申请人需要认真准备材料并按要求操作，避免因疏忽导致材料被退回。